在台灣，如果要設立電影院的話，要向當地縣市政府登記。而在日本，設立電影院要向當地的「保健所」(相當於台灣各地的衛生所) 登記。

有些經常會注意日本電影的台灣人可能會發現，在日本電影的海報或是廣告上常常可以看到「東寶系」、「東映系」、「松竹系」這樣的文字，所謂的「○○系」指的是電影公司旗下的電影院。其實日本的電影公司很多，而東寶、東映以及松竹是比較大的三家公司，因此曝光率也相對地較高。

「東寶」在最早叫作「東京寶塚劇場」，是日本最大的電影公司，東寶旗下專屬電影院也最多，東寶除了自己的日片之外，還和美國華納公司合作，引進洋片，因此賣座的電影通常都是在「東寶系」的電影院放映。台灣人比較常聽到的「電車男」、「火影忍者」電影版、「神奇寶貝」電影版等都是東寶所發行的。

「東映」最早叫作「東京映畫配給」，旗下的電影院是以播映日本的國片為主。其中「七龍珠」電影版動畫、「航海王」(ONE PIECE) 電影版動畫，以及80年代的宮崎駿系列電影等，都是東映所發行的。而東映除了電影之外，也跨足了許多日本電視節目的製作，例如暴坊將軍系列、東映戰隊系列，平成假面騎士系列等。

「松竹系」的電影院也是以日本的國片為主，「松竹」一詞是由公司的兩個創立者的名字各取一字而成的。松竹的電影最有名的是世界最長的電影系列「男はつらいよ」。而在台灣比較有知名度的作品則是「盲劍俠」(座頭市)。在洋片方面則是和東急合作，於「松竹・東急系」的電影院放映。

除了電影公司旗下的電影院之外，日本也有不屬於任何電影公司的獨立電影院。不過因為這些電影院沒有大公司的財力，所以通常是不到200個座位以下的小戲院，而這些戲院通常都是向各電影公司引進日片及洋片放映。當然，也有一些獨立電影院是專門放映成人電映的。

日本還有一種專門播映舊片的「名畫座」電影院，有點類似台灣的二輪片電影院。不過因為日本的一般電視頻道經常會播映一兩年內的賣座電影，而且DVD出租店又相當普及，因此這種資本較小的「名畫座」電影院在競爭上處於弱勢，所以無法形成像台灣一樣的二輪片電影院文化。